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연구관련112

HuEx-1_0-st-v1 cdf 처리 문제 HuEx-1_0-st-v1 은 HuEx-1_0-st-v2 의 cdf 이용하면 된다. 구글 검색어:HuEx-1_0-st-v2 HuEx-1_0-st-v1 http://www.aroma-project.org/chipTypes/HuEx-1_0-st-v2/ Note II: Older CEL files for this chip type, may be reported to have chip type 'HuEx-1_0-st-v1'. This chip is slightly different from the 'HuEx-1_0-st-v2' chip. According to Affymetrix support, the difference is only in the control probes; "There is only a mi.. 2016. 5. 5.
드뎌! 서버 미러링 작업중. 약간 병적으로 집착하는 것은, ㅋㅋ, 데이터가 날아가지 않을까, 하는 것. 왜 그런지 정확히는 모르겠지만 지금까지 HDD 가 망가진 경우가 많다. bad sector 같은 것이 생겨서 못 쓰게 된 HDD 만 모아 놓아도 열 개는 족히 되리라. 그래서 항상 데이터의 백업에 집착하곤 했었지, ㅋㅋ. 그래서 dropbox 가 나왔을 때도 꽤 이른 시기부터 사용했었다. 유료로 사용한지도 꽤 되었지. 아, 물론, 아이 클라우드 역시 한 달에 천원 더 내고 50GB 사용 중. 내 생각은 항상 그랬다, 핸드폰이나 컴퓨터같은 딱딱한 기계 덩어리가 문제가 아니라 그 안에 들어 있는 데이터가 문제다, 따라서 기계가 망가지는 것은 관심 없고 데이터가 날아 가는 것이 문제다! 뭐... 물론 기계가 망가져도 가슴이 좀 아프지만.. 2015. 12. 5.
노가다에 의한 철야? 오래간만이다, 이 시간까지 있는 것이. 물론 집에 들어 간다고 해도 보통 2시 정도에 자기는 하는데, 연구실에 이 시간까지 있던 경우는 꽤 오랜만이다. 아무래도 모니터를 두 개 사용하고, 키보드를 사용하는 것이 랩탑을 이용하는 것보다 편하다보니 뭔가 마우스와 키보드를 오가며 해야 할 일이 있을 경우에는 연구실에 늦게까지 있게 되곤 한다. 코딩이라면야 방에 들어가서 침대에 누워서도 할 수 있으니 일찍 - 그래봐야 10시에서 12시 정도지만 - 들어 가곤 하는데 말이다. 왠만한 것들은 코딩을 해서 해결하려 하지만, 결코 코딩으로 해결할 수 없는 경우들이 있다. 이런 경우 엄청난 노가다를 며칠이고 하곤 한다. 어쩔 수 없지, ㅋ. 엑셀을 매우 많이 한다거나, 하여튼 그런 것. 지금은 한문으로 된 문서를 분석하.. 2015. 3. 5.
autodock vina를 직접 compile 해서 사용하기 protein-chemical binding affinity 를 계산하는 프로그램인 autodock vina 를 컴파일 해보자. 컴파일을 하는 이유는 실제로 이 프로그램을 실행시킬 컴퓨터에서 컴파일을 해서 사용하면 제공되는 실행 파일을 이용하는 것보다 속도가 좀 더 빠르기 때문이다. 정확한 test 는 아니지만 linux > windows 8 > windows 7 순서로 속도가 빠른 것을 확인할 수 있었고, 각 경우 언제나 직접 컴파일 한 실행 파일이 속도가 더 빠르게 나왔다. 위 결과는 컴퓨터가 아주 안좋은 경우부터 아주 좋은 경우까지 모두 해당된다. 리눅스에서의 컴파일 윈도우즈에서의 컴파일 리눅스에서의 컴파일 우선 결론적으로 정리된 절차는 다음과 같다. 32bit 운영체제(OS)에서 한 것이기 때문에.. 2014. 11. 25.