본문 바로가기

pubmed2

pubmed 사용법 Pubmed 는 생물학 관련 논문들의 초록 정보를 담고 있는, 세계에서 가장 방대한 데이터베이스 중의 하나이며 미국국립보건원에서 관리하고 있다. 출간되는 생물학 관련 논문의 대부분은 pubmed에 기록이 올라 가며, 따라서 논문 검색을 할 때 구글(또는 구글 스칼라)과 더불어 가장 유용한 싸이트라 하겠다. 이 글은 pubmed 에서 검색하는 방법을 설명한다. Pubmed는 NCBI의 하위 경로로 들어갈 수도 있고, 그냥 www.pubmed.com 으로도 들어갈 수 있다. 검색방법은 간단한데, 그냥 검색어를 나열하면 된다. 위와 같이 생긴 검색어 입력 창에 검색어를 입력하면 된다. 일반적으로 유전자(단백질)의 이름은 MeSH term에 의해 동의어 검색까지 모두 되므로, 공식적인 gene symbol 로 .. 2010. 7. 22.
Pubmed eUtils 사용하기 URL 을 이용하여 Pubmed 검색 결과를 얻을 수 있는 방법이 eUtils를 이용하는 것이다. 이것을 이용하면 EndNote 에서 Pubmed 검색 결과를 가져 오는 것을 직접 구현할 수 있다. 자세한 내용은 eUtils 홈페이지에 잘 나와 있다. 여기서는 몇 가지 예를 살펴 보고, 실제로 내가 사용하는 파이썬 스크립트를 올려 놓는다. 다음과 같이 URL 뒤에 적절한 조건을 넣어서 요청을 하면 eUtils 서버에서 결과를 돌려 준다. search_text = 'TAK1[Text]'; search_address = 'http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=pubmed&retmax=1000&term='+search_text.replac.. 2010. 7. 2.