연구관련112 쳇, 나이 들었어, >.<"" 방금 연구실 동생이랑 한 카톡 한 컷. 그러하다. 요즘엔 대략 10시 정도면 들어 온다. 물론, 들어 와서도 여전히 코딩을 하긴 하는데, 침대에 누워 편안하게, ㅋㅋㅋ. 저 녀석은 남자 녀석이라 12시든 몇시든 편안하게 내 시간에 맞추라고 했을텐데, 이젠 내가 힘들다. 물론 아침엔 9~10시 사이에 나가니까 연구실에 있는 시간 자체는 12시간인데, 예전의 15시간 정도에 비해서 줄긴 했다. 뭐, 일하는 시간 자체는 거의 그대로일텐데 좀 편하게 일을 하고자 집에 일찍 들어 온다. 이 곳이 워낙 시차가 다른 곳이랑 달라서 저녁 10시면 이른 시간. 오전/오후를 생략한 채 대화를 하면 익숙치 않은 사람은 정반대로 이해할 가능성이 매우 높은 대화가 종종 이루어 진다. 그런데, 막상 지금은 연구에 집중하는 시기이.. 2014. 3. 24. pathway database 종류 및 특성 신호전달경로 혹은 metabolism 등의 pathway 를 볼 수 있는 database들은 다음과 같다. + WikiPathway+ KEGG Pathway+ Reactome+ MetaCyc + NetPath and NetSlim 또한, NetPath나 NetSlim, WikiPathWay 에 나온 것과 같은 pathway 를 그리고 수정할 수 있는 프로그램으로는 PathVisio 라는 것이 있다. 여러 Pathway 에 관한 db의 링크를 나열해 놓은 것은 www.pathguide.org 가 있다. 온갖 DB 들이 pathguide 에 있으니 자세한 것들은 이 곳을 보면 되는데 더이상 운영되지 않는 site들도 여럿 있다. 그냥 diagram만 보고 싶으면 Cell 에서 제공하는 snapshot이나 b.. 2014. 3. 18. ConnectivityMap 의 chemical 정보 가져 오기 Connectivity Map (CMap) 은 1,308 개의 chemical 을 몇 가지 cell-line 에 treatment 하기 전/후에서의 gene expression profile 을 microarray 로 측정한 결과를 제공해 주는 database 이다. raw CEL file 과 각 실험 조건에 관한 정보 파일을 download 할 수 있기는 한데, 문제는 각 실험에 사용된 chemical 의 정보가 이름밖에 없다는 것이다. 보통 chemical 이름은 동의어가 여럿 있기 때문에 이 이름만 갖고 일을 하는 것은 쉽지 않다. CCLE나 DrugBank, TTD, GDSC, PubChem, TCM@Taiwan, Chembl, clinicaltrails.org 에 있는 자료랑 같이 사용할 때 동.. 2014. 3. 10. 내자리, ㅋ. 창가 덕후, ㅋㅋㅋ. 파티션이랑 붙이면서 배치를 시도하다 결국 창가 쪽으로 붙이기 위해 이렇게 빼 놓았다. 낮에 일을 하면 햇살이 강하게 빛나 눈이 부시면 블라인드를 치고 일을 하다, 저녁 즈음이 되어 눈부시지 않을 햇살이다 싶으면 다시 걷고 밖을 볼 수 있게 한다. 모니터 바로 뒷면이 해가 지는 자리라 노을을 자주 볼 수 있어서 좋다. 창문이 개방되지 않는 것이라 닦을 수 없어서 좀 지저분한 것이 흠이라면 흠일까, 지는 해를 자주 볼 수 있다는 것만으로도 만족한다. 창문 청소는 년중 행사로 건물 외벽을 청소하시는 분들이 해줘야 할 수 있어서 어쩔 수 없이 지저분해도 참아야 한다. 이건 지금 내자리, ㅋ. 본체 3대에 모니터 5개. 이제 곧 있으면 오는 후배 데스크탑을 사용하고 있는지라 그 아이가 오면 .. 2014. 2. 28. 이전 1 2 3 4 5 6 7 8 ··· 28 다음
