진화하자 - 어디에도 소속되지 않기

To foreigners

If you have any question or request, feel free to make me know that. If I think the request is helpful to others I am willing to post it in English. [Read more]

분류없음 adnoctum 2011.06.10 1 comment

블로그 이용 방법

이곳에 있는 글을 읽고, 그것에 대한 반응을 할 경우 아래의 내용을 지켜 주세요. 답글을 다는 것, 글을 읽고 소통하는 자세, 카테고리, 웹브라우저, 소스코드 이용 방법에 관한 내용입니다.[더보기]

분류없음 adnoctum 2011.03.28 0 comment

dense subgraph 찾기 구현 (MCODE)

지난 번 글에서 언급했던 알고리즘을 C++로 직접 구현해 보자. 실제로 사용한 예는 다음과 같다. 원래의 network 은 다음과 같다. 우리는 다음과 같은 network 에서 dense 한 sub-grap​h 즉, edge가 많이 연결된 sub-..

연구관련/Bioinfo류 adnoctum 2010.12.03 1 comment

Fisher's linear discriminant 원리

Fisher's linear discrimi​nant (FLD) 는 데이터를 여러 변수들의 선형결합으로 표현하였을 때 서로 다른 그룹을 잘 구분할 수 있게 해 주는 coeffici​ent 를 찾는 방법이다. 그림으로 보자면 다음과 같다. 위는 그림..

컴퓨터/수학이랑 adnoctum 2010.11.30 2 comment

엑셀에서 z-score로 p-value 계산하기

데이터를 정규화한 값인 z-score 를 이용하여 p-value를 계산해 보자. 이 때, erf 함수를 사용하게 되는데 ms-excel​ 에서 erf 함수를 제공해 준다, 따라서 이 값을 엑셀에서 계산해 보자. 많은 경우 모분포의 정규분..

컴퓨터/수학이랑 adnoctum 2010.10.12 0 comment

NF-kappaB

Introduc​tion Nuclear Factor-k​appaB(NF-κB)는 세포의 생존, 면역 반응 등에 광범위하게 작용하는 전사인자(Transcri​ption Factor, TF)이다. 다른 많은 전사 인자가 그렇듯 NF-κB 역시 작용하는 세포의 종류와 작..

연구관련/신호전달 adnoctum 2010.01.17 0 comment

유비퀴틴(ubiquitin)과 ubiquitination

유비퀴틴은 amino acid 76개로 이루어진 작은 단백질로, 주요한 역할은 분해되어야 할 단백질을 표지하는 것이다. 즉, 유비퀴틴이 붙은 단백질은 proteaso​me에 의해 분해된다. 오랜동안 유비퀴틴의 기능은 이러한 분..

연구관련/세포생물학 adnoctum 2010.03.25 1 comment

혈액형과 수혈, 그리고 면역 시스템

들어 가기에 앞서. 무엇인가를 제대로 설명하려면 그 이전에 알아야 할 것이 많은 경우가 있다. 매우 단순화함에도 불구하고, 지금 내가 말하려는 것도 그러한데, 앞 부분에는 전혀 상관없어 보이는 이야기가 있을 ..

연구관련/그냥생물학 adnoctum 2010.02.01 4 comment