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pubmed 사용법 Pubmed 는 생물학 관련 논문들의 초록 정보를 담고 있는, 세계에서 가장 방대한 데이터베이스 중의 하나이며 미국국립보건원에서 관리하고 있다. 출간되는 생물학 관련 논문의 대부분은 pubmed에 기록이 올라 가며, 따라서 논문 검색을 할 때 구글(또는 구글 스칼라)과 더불어 가장 유용한 싸이트라 하겠다. 이 글은 pubmed 에서 검색하는 방법을 설명한다. Pubmed는 NCBI의 하위 경로로 들어갈 수도 있고, 그냥 www.pubmed.com 으로도 들어갈 수 있다. 검색방법은 간단한데, 그냥 검색어를 나열하면 된다. 위와 같이 생긴 검색어 입력 창에 검색어를 입력하면 된다. 일반적으로 유전자(단백질)의 이름은 MeSH term에 의해 동의어 검색까지 모두 되므로, 공식적인 gene symbol 로 .. 2010. 7. 22.
몇 가지 간단한 리눅스 명령어의 실제 사용예 이 글에 나온 실제 사용 예들은 계속 추가할 생각이다. 가장 최근 수정일 : 2010-09-06 2010-08-31 2010-08-10 2010-07-21 각 명령어의 간단한 설명은 이 글의 뒤쪽에 있음. 리눅스의 명령어에 관한 좋은 설명은 아래의 책 (검색링크)에 나와 있다. 좋은 책을 보면 막 홍보해주고 싶다는. 자잘한 리눅스 명령어의 묘미는 입력/출력을 다음 프로그램에 곧바로 집어 넣을 수 있다는 것. 예를 들어 보자. test.txt 파일이 다음의 내용이 다음과 같다고 하자. 각 데이터는 유전자 1개를 나타내는 ID (01045처럼) 와 유전자의 이름(BCL2처럼)으로 되어 있다. 01045:BCL2(-) 00291:CTSD 01045:BCL2(-) 00169:CALR 01045:BCL2(-) 0.. 2010. 7. 21.
다섯째 날 강연 2008년 3월 29일 토요일 - 다섯째 날 강연 2008년 3월 29일 토요일 오후 8시 50분 (한국 시간: 2008년 3월 30일 새벽 5시 50분) 오늘 세션은 circadian rhythm과 발생에 관련된 것으로 나와는 별로 상관이 없는 분야였다. Hiroki Ueda라는 일본인이 좌장이었는데, circadian rhythm에 대해 introduction을 하였다. 나는 여태까지 circadian rhythm을 단순히 아침에 일어 나는 것과 잠자는 것 정도를 조절하는 것으로 생각하였는데, 어떤 약물의 경우 특정 시간대에만 더 효과가 있는 등 circadian rhythm은 내가 생각했던 것 이상으로 우리 몸을 조절하고 있다고 한다. 첫 번째 강연은 photo-stimuli를 시각신경에서 직접 받.. 2010. 7. 19.
넷째 날 - 강연 2008년 3월 28일 금요일 - 넷째 날 강연 2008년 3월 28일 금요일 오후 1시 (한국 시간: 2008년 3월 28일 금요일 오후 10시) 오늘의 첫 번째 강연은 bacteria의 flagella를 조절하는 pathway가 왜 여러 개 존재하는가에 대한 것이었다. 두 번째 강연은 glycolysis pathway를 reconstruction하는 것이었는데 발표가 전혀 구조적이지 않았고 내용도 그리 썩 와 닿지 않았다. 세 번째 강연은 cell cycle protein들이 transcription과 post-translational regulation에 의해 동시에 조절받는 것에 대한 것이었다. 네 번째 발표는 budding yeast가 budding을 할 때의 membrane의 dynamics에.. 2010. 7. 19.

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